O Colégio São Domingos ocupa uma área total de 4.000 metros quadrados no bairro de Perdizes. Um casarão antigo abriga o setor pedagógico e administrativo da escola bem como alguns espaços de uso coletivo, enquanto as salas de aula situam-se em construções mais recentes. No São Domingos o contraste entre a arquitetura antiga e moderna compõem um ambiente escolar especial.
Além das salas de aula o Colégio dispõe de outros ambientes onde se complementa o trabalho pedagógico:
- Ateliê de artes
- Laboratório de ciências
- Biblioteca
- Quadras poliesportivas
- Sala multimídia
- Sala de informática
- Pátios